本研究科では，近年，急速に新興しつつある疾病への対応や予防医学などの国家的課題，個別化医療といった広範囲な研究領域を背景とする社会ニーズに対し，その一つの中心的課題である創薬をテーマとして，創薬を取り巻く，生体分子化学，生体制御，生体応答，生物学的創薬，薬効情報，患者情報までの全ての情報を広義の医療情報と捉え，これを数理的・情報科学的手法を駆使して教育研究を実施する。

すなわち，「創薬」の分野をメタボリックパスウェイに代表される生体データや代謝情報，患者情報などの広義の「医療情報」の解析をとおして，解明，創造(開発)，検証，応用に展開しようとする教育研究体系であり，研究科名称を「大学院連合創薬医療情報研究科」とする。